Mata kuliah ini memberikan pemahaman komprehensif tentang interaksi inang-patogen dengan pendekatan molekuler, mencakup seluruh tahapan dari penetrasi, infeksi, kolonisasi hingga respons tumbuhan. Fokus utama meliputi analisis genetik dan regulasi pada tingkat molekuler, termasuk studi tentang gen mikroba dan tumbuhan beserta mekanisme transduksi sinyal yang mengendalikan interaksi tersebut. Pembelajaran akan mengkaji secara mendalam berbagai patogen tanaman, termasuk: (1) bakteri fitopatogen dan endofit dengan bahasan menyeluruh tentang siklus hidup, genom, faktor virulensi, sistem sekresi, dan mekanisme interaksi; (2) jamur fitopatogen yang mencakup aspek struktural, biokimia, siklus hidup, serta strategi infeksi dan pertahanan inang. Materi juga membahas interaksi tumbuhan dengan virus dan oomycetes, serta mekanisme pertahanan tanaman secara holistik. Melalui pendekatan multidisiplin yang mengintegrasikan prinsip biokimia, biologi molekuler, genetika, dan fisiologi, mata kuliah ini tidak hanya mengembangkan pemahaman teoritis tetapi juga membekali mahasiswa dengan teknik-teknik terkini dalam penelitian interaksi tumbuhan-mikroba. Aspek aplikatif dari hubungan tumbuhan-mikroba, termasuk dampak ekologis dan sosialnya, turut menjadi bagian penting dalam pembahasan untuk memberikan perspektif yang lebih luas tentang relevansi ilmu ini dalam konteks nyata.